Märkpennor är pennor med permanent bläck. De används när man skall märka något. Bläcket i dessa pennor tål både minus- och plusgrader. Det finns olika typer av märkpennor, såsom till märkning av kläder och till märkning av glas, metall och annat. Idag finns miljövänliga märkpennor från Pilot (V Super Color) där pennkroppen är tillverkad av återvunnen plast.